MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. IPAV chromosome chromosome 1

Total Repeats: 69452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017551	GGA	2	6	242	247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386072489
2	NC_017551	GAA	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072489
3	NC_017551	A	7	7	291	297	100 %	0 %	0 %	0 %	386072489
4	NC_017551	AGAA	2	8	404	411	75 %	0 %	25 %	0 %	386072489
5	NC_017551	TAT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072489
6	NC_017551	AGC	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386072489
7	NC_017551	TA	4	8	655	662	50 %	50 %	0 %	0 %	386072489
8	NC_017551	GTAGGA	2	12	672	683	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	386072489
9	NC_017551	A	6	6	723	728	100 %	0 %	0 %	0 %	386072489
10	NC_017551	TATGT	2	10	745	754	20 %	60 %	20 %	0 %	386072489
11	NC_017551	TCT	2	6	762	767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072489
12	NC_017551	ATGA	2	8	771	778	50 %	25 %	25 %	0 %	386072489
13	NC_017551	GAT	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072489
14	NC_017551	TC	3	6	872	877	0 %	50 %	0 %	50 %	386072489
15	NC_017551	A	6	6	889	894	100 %	0 %	0 %	0 %	386072489
16	NC_017551	T	6	6	906	911	0 %	100 %	0 %	0 %	386072489
17	NC_017551	GAAA	2	8	933	940	75 %	0 %	25 %	0 %	386072489
18	NC_017551	TCA	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072489
19	NC_017551	AT	3	6	1114	1119	50 %	50 %	0 %	0 %	386072489
20	NC_017551	T	6	6	1124	1129	0 %	100 %	0 %	0 %	386072489
21	NC_017551	GAA	2	6	1143	1148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072489
22	NC_017551	CTT	2	6	1158	1163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072489
23	NC_017551	ATTT	2	8	1182	1189	25 %	75 %	0 %	0 %	386072489
24	NC_017551	A	6	6	1194	1199	100 %	0 %	0 %	0 %	386072489
25	NC_017551	TCT	2	6	1208	1213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072489
26	NC_017551	T	7	7	1213	1219	0 %	100 %	0 %	0 %	386072489
27	NC_017551	GAAA	2	8	1235	1242	75 %	0 %	25 %	0 %	386072489
28	NC_017551	A	6	6	1247	1252	100 %	0 %	0 %	0 %	386072489
29	NC_017551	A	8	8	1266	1273	100 %	0 %	0 %	0 %	386072489
30	NC_017551	AATTT	2	10	1318	1327	40 %	60 %	0 %	0 %	386072489
31	NC_017551	AGAA	3	12	1356	1367	75 %	0 %	25 %	0 %	386072489
32	NC_017551	AT	3	6	1384	1389	50 %	50 %	0 %	0 %	386072489
33	NC_017551	TTTA	2	8	1393	1400	25 %	75 %	0 %	0 %	386072489
34	NC_017551	AC	3	6	1457	1462	50 %	0 %	0 %	50 %	386072489
35	NC_017551	CTT	2	6	1497	1502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072489
36	NC_017551	CAA	2	6	1505	1510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072489
37	NC_017551	T	6	6	1523	1528	0 %	100 %	0 %	0 %	386072489
38	NC_017551	TAC	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072490
39	NC_017551	AG	3	6	3290	3295	50 %	0 %	50 %	0 %	386072490
40	NC_017551	TAT	2	6	3306	3311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072490
41	NC_017551	TC	3	6	3349	3354	0 %	50 %	0 %	50 %	386072490
42	NC_017551	TCAA	2	8	3374	3381	50 %	25 %	0 %	25 %	386072490
43	NC_017551	CTG	2	6	3393	3398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386072490
44	NC_017551	AAG	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072490
45	NC_017551	AAC	2	6	3435	3440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072490
46	NC_017551	T	6	6	3449	3454	0 %	100 %	0 %	0 %	386072490
47	NC_017551	AGA	2	6	3490	3495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072490
48	NC_017551	TTC	2	6	3508	3513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072490
49	NC_017551	TGA	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072490
50	NC_017551	TTC	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072490
51	NC_017551	TCT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072490
52	NC_017551	CTT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072490
53	NC_017551	TTG	2	6	3747	3752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072490
54	NC_017551	GAA	2	6	3762	3767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072490
55	NC_017551	CTTC	2	8	3791	3798	0 %	50 %	0 %	50 %	386072490
56	NC_017551	TAT	2	6	3820	3825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072490
57	NC_017551	ACA	2	6	3924	3929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072490
58	NC_017551	TAT	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072490
59	NC_017551	ATTG	2	8	3946	3953	25 %	50 %	25 %	0 %	386072490
60	NC_017551	AGA	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072490
61	NC_017551	AGA	2	6	4063	4068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072490
62	NC_017551	AATTTA	2	12	4106	4117	50 %	50 %	0 %	0 %	386072490
63	NC_017551	GAC	2	6	4235	4240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386072490
64	NC_017551	ATTT	2	8	4309	4316	25 %	75 %	0 %	0 %	386072490
65	NC_017551	GAA	2	6	5046	5051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072491
66	NC_017551	T	8	8	5080	5087	0 %	100 %	0 %	0 %	386072491
67	NC_017551	TAT	2	6	5137	5142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072491
68	NC_017551	ATT	2	6	5203	5208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072491
69	NC_017551	AAAATT	2	12	5288	5299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386072491
70	NC_017551	AAG	2	6	5305	5310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072491
71	NC_017551	A	8	8	5315	5322	100 %	0 %	0 %	0 %	386072491
72	NC_017551	TAT	2	6	5353	5358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072491
73	NC_017551	GGT	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072491
74	NC_017551	CGG	2	6	5395	5400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386072491
75	NC_017551	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072491
76	NC_017551	TTC	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072491
77	NC_017551	ATA	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386072491
78	NC_017551	A	7	7	5547	5553	100 %	0 %	0 %	0 %	386072491
79	NC_017551	CAA	2	6	5579	5584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386072491
80	NC_017551	AAG	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072491
81	NC_017551	GTT	2	6	5595	5600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072491
82	NC_017551	GGA	2	6	5646	5651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386072491
83	NC_017551	GAT	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072491
84	NC_017551	A	6	6	5833	5838	100 %	0 %	0 %	0 %	386072491
85	NC_017551	GGC	2	6	5861	5866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386072491
86	NC_017551	ATT	2	6	5875	5880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072491
87	NC_017551	TGA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072491
88	NC_017551	AGA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072491
89	NC_017551	T	7	7	5993	5999	0 %	100 %	0 %	0 %	386072491
90	NC_017551	ACG	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386072491
91	NC_017551	GAA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072492
92	NC_017551	A	6	6	6192	6197	100 %	0 %	0 %	0 %	386072492
93	NC_017551	GAAA	2	8	6226	6233	75 %	0 %	25 %	0 %	386072492
94	NC_017551	TTG	2	6	6234	6239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072492
95	NC_017551	T	7	7	6333	6339	0 %	100 %	0 %	0 %	386072492
96	NC_017551	ATC	2	6	6350	6355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386072492
97	NC_017551	TCGT	2	8	6387	6394	0 %	50 %	25 %	25 %	386072492
98	NC_017551	CTT	2	6	6426	6431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072492
99	NC_017551	A	8	8	6459	6466	100 %	0 %	0 %	0 %	386072492
100	NC_017551	A	6	6	6527	6532	100 %	0 %	0 %	0 %	386072492
101	NC_017551	TTC	2	6	6546	6551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072492
102	NC_017551	AAG	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072493
103	NC_017551	A	7	7	6887	6893	100 %	0 %	0 %	0 %	386072493
104	NC_017551	GTT	2	6	6908	6913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386072493
105	NC_017551	GGT	2	6	6932	6937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072493
106	NC_017551	ATG	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072493
107	NC_017551	TGGGGT	2	12	6979	6990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072493
108	NC_017551	GAAGTT	2	12	7022	7033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386072493
109	NC_017551	TTC	2	6	7084	7089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072493
110	NC_017551	TTC	2	6	7108	7113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072493
111	NC_017551	CCA	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386072493
112	NC_017551	TTCT	2	8	7185	7192	0 %	75 %	0 %	25 %	386072493
113	NC_017551	T	6	6	7213	7218	0 %	100 %	0 %	0 %	386072493
114	NC_017551	GGTTT	2	10	7226	7235	0 %	60 %	40 %	0 %	386072493
115	NC_017551	GGAAA	2	10	7259	7268	60 %	0 %	40 %	0 %	386072493
116	NC_017551	ACGAA	2	10	7276	7285	60 %	0 %	20 %	20 %	386072493
117	NC_017551	TTTC	2	8	7308	7315	0 %	75 %	0 %	25 %	386072493
118	NC_017551	AAAC	2	8	7333	7340	75 %	0 %	0 %	25 %	386072493
119	NC_017551	GAC	2	6	7379	7384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386072493
120	NC_017551	ACAA	2	8	7445	7452	75 %	0 %	0 %	25 %	386072493
121	NC_017551	A	6	6	7528	7533	100 %	0 %	0 %	0 %	386072493
122	NC_017551	A	6	6	7550	7555	100 %	0 %	0 %	0 %	386072493
123	NC_017551	AAG	2	6	7587	7592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072493
124	NC_017551	CCTCAA	2	12	7622	7633	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	386072493
125	NC_017551	T	6	6	7718	7723	0 %	100 %	0 %	0 %	386072493
126	NC_017551	A	6	6	7744	7749	100 %	0 %	0 %	0 %	386072493
127	NC_017551	GAA	2	6	7818	7823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072493
128	NC_017551	GGT	3	9	7838	7846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072493
129	NC_017551	GGT	2	6	7925	7930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386072493
130	NC_017551	TTC	2	6	7968	7973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072493
131	NC_017551	GAA	2	6	8033	8038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072493
132	NC_017551	ATTATG	2	12	8117	8128	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386072493
133	NC_017551	CTT	2	6	8168	8173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386072493
134	NC_017551	T	6	6	8180	8185	0 %	100 %	0 %	0 %	386072493
135	NC_017551	CCT	2	6	8234	8239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386072493
136	NC_017551	TTAA	2	8	8246	8253	50 %	50 %	0 %	0 %	386072493
137	NC_017551	AAGGAA	2	12	8288	8299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386072493
138	NC_017551	ATT	2	6	8302	8307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386072493
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